ログイン後のチェックインお知らせメッセージを非表示にできますか？

できます。

(管理者権限が必要です。)
まず、[プレゼンス]の画面右上の[歯車マーク]＞[システム管理]＞[共通設定]を開きます。
次に、[ログイン後のチェックインお知らせメッセージ]で[表示しない]を選択します。
最後に、[変更]をクリックすると完了です。
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