[共通就業設定]や[個別就業設定]を変更した場合、既にある実績の集計は即時で変更となりますか？

即時で変更となります。
ただし[反映日]を過去日とした場合において、手動で登録したような実打刻がない実績で、[締め]または[確定]を行なってないデータは、時間がクリアされますのでご注意ください。