請求の基準となる容量は「利用可能容量」と「配信利用可能量」、どちらの容量になりますか？

基本的にそれぞれが基準の容量となります。
「利用可能容量」で50GB、「配信利用可能量」で50GBずつ利用ができ、そちらが基準となります。

例：「利用可能容量」で60GB、「配信利用可能量」で40GBの利用があった場合
⇒利用可能容量のみ10GB分の超過料金が発生

例：「利用可能容量」で100GB、「配信利用可能量」で100GBの利用があった場合
⇒利用可能容量で50GB分の超過、配信利用可能量で50GB分の超過となり
計100GBの超過料金の請求が発生します。