[会員情報管理]でのユーザー新規登録時に[ユーザー部署名]を設定しましたが、グループウェアの組織(部門、グループ、部署など)が設定されていません。

ユーザー新規登録画面の[ユーザー部署名]は、グループウェアには反映されません。
別途、グループウェアの画面で組織に所属させる設定が必要です。

関連情報はこちら。
ユーザーを組織(部門、グループ、部署など)に所属させる方法を教えてください。